在游戏的最初或者死亡后，如果玩家还没有钱，系统会分配一搜免费的最基础飞船(逃生舱)供你使用。这种基础飞船的装载能力和武器装备都是非常落后的，甚至都没有跃迁引擎，但是玩家可以去最近的星球上获得相关的资源来升级飞船各方面的能力，同时也能通过一些“非法”途径偷取全新的飞船。
飞船拥有各式各样的升级内容，包括速度、操控性、跃迁距离和火力等。当玩家攒够一定的钱之后，你可以购买一艘全新的飞船。此时玩家可以去空间站里选购各式各样的飞船，而这些飞船是滚动售卖的，所以如果玩家遇上看对眼的飞船得赶紧下手，很可能新货一来它们就没了。
通过在宇宙的更深处发现更先进和更有用的蓝图，玩家能够解锁新的制造组件，这可以让你不需要购买新的装备，直接升级你现有的衣服、飞船和武器。玩家通过获得蓝图才能制造物品，而制造物品又需要消耗资源，这些资源又需要玩家不断的在各个星球上通过采矿和交易获得，制造用的组件和货物一样会占用玩家的运输空间，所以有一艘大飞船非常重要，玩家们需要不断努力升级改造自己的飞船，而这个过程也是环环相扣，周而复始的。目前无人深空已经上线了动物驯养元素，随着游戏新内容的不断更新，相信开发团队会带来更多免费的新元素，比如可能会有的多人模式、建造基地元素、陆地载具和控制大型运货船等元素。希望能带给玩家们更多惊喜。
