Dnaman

Dnaman提供了分子生物学领域的DNA与蛋白质序列设计功能，学者可在开始PCR或测序实验之前，用此软件设计引物，并预测结果。此软件能够把设计出的DNA与蛋白质序列保存为出版品质的图片，可插入到论文中作为补充内容。

安装步骤

1、双击.exe文件进入DNAMAN安装导向界面，点击【Next】继续安装。

2、进入安装协议界面，点击【I accept the agreement】，然后点击【next】。

3、选择安装位置，点击【next】，软件会默认安装，或者您可以点击【Browse】，弹出安装位置界面，您可以自己选择安装位置，选择完成后点击【NEXT】。

4、准备安装，您可以检查一下软件安装位置是否正确，如果正确点击【Install】。

5、软件正在安装中，您需要耐心等待软件安装。

6、软件安装完成，点击【finish】退出软件安装。

汉化教程

1、安装完成后将汉化补丁复制到安装目录下替换源文件即可，一般默认安装目录为：C:Program Files (x86)DNAMAN。

2、双击_patch.exe，点击【下一步】。

3、点击【开始】就可以。

4、软件会自动汉化，点击确定就可了。

软件特色

1、DNA和蛋白质序列编辑。

2、DNA序列转化。

3、多序列比对，对齐编辑和分析。

4、系统树分析。

5、DNA或蛋白质序列的点阵比较。

6、DNA序列组装和编辑。

7、BLAST通过网络界面在Intranet / Internet Server上进行搜索。

8、序列和数据库中的增强型图案搜索。

9、SiRNA选择器。

10、限制分析。

11、绘制序列图与出版品质。

12、限制模式预测。

13、电子克隆。

14、从限制片段重建限制图。

15、静音突变分析创建/破坏限制性位点。

16、导向不匹配以创建/破坏限制站点。

17、翻译和密码子使用分析。

18、蛋白质疏水性/亲水性分析。

19、蛋白质表征：等电点的序列组成和预测。

20、蛋白质二级结构预测。

21、反向翻译。

22、PCR和测序引物的设计。

23、表征DNA或引物序列的热力学性质。

24、分歧分析。

25、管理寡核苷酸，DNA和蛋白质数据库。

26、生成随机序列。

使用方法

1、打开软件点击软件顶部的点击File，在弹出的选择中选择new。

2、在新建好的对话框中输入DNA序列。

3、输入完后，同时按住键盘上Ctrl和A，选中序列，并单击软件顶部“seq”图中以为大家标注出来。

4、然后点击软件顶部的Sequence选项，在弹出的选项中点击Display，在二级菜单中点击Rev.Compl.Sequence。

5、然后就可以得到原序列的反向互补序列。

设计引物

1、先要拿到自己要设计引物的目的基因。

2、打开软件，打开软件后点击软件菜单栏的Primer选项，在弹出的选择中选择Load Primer，在二甲菜单中选择From Input选项。

3、导入文件后，点击菜单栏的Primer选项，在弹出的选项中选择Melting Temperature。

4、打开Melting Temperature对话框，您可以修改Thermo这个选项，Thermo值一般在55℃到70℃之间比较好。

5、从上图可以看到我们这20个碱基的Tm值只有49度，显然太低，需要增加碱基数量。我们取前24个碱基粘贴进去，点击下方Show Tm便可以看到这个引物的Tm值，发现是60.3度，很合适，就用这个了。这样正向引物就设计完了，把这24个碱基序列保存下来。

常见问题

若何用软件导出序列比对图?

1、翻开软件，翻开软件后，点击菜单栏的Sequence选项，在弹出的选项当选择Load Sequence，在弹出的二级菜单中点击Multiple，选择您要加入对照的文件。

2、导入序列后，点击Sequence，在弹出的选项中选择Alignment，再选择Multiple Sequence Alignment，参数全部保持默认，点“下一步”就可以。

3、然后便可以获得终究对照成果。

软件性能

1、信息库办理

选择信息库|司理指令翻开信息库办理器对话框。

2、DNA和卵白质信息库

该软件的信息库性能，许可用户组织DNA和卵白质序列的各种科目。

3、编纂记载信息

有关特定记载的信息可以编纂。在序列列表框中，一切记载按字母顺序或记载顺序列出。每一个记载名字的数目展示记载的记载号ID.用软件主动分派。是以，您可觉得各种的记载运用一样的称号。

4、扫描序列的类似性

它扫描一切的序列记载在默许的信息库搜刮以后序列的同源序列。若是默许信息库包括DNA序列，则默许序列必需是DNA序列。若是默许信息库包括卵白质序列，则默许序列必需是卵白质序列。将运用迅速瞄准方式扫描信息库的序列类似性。您可以选择对成果的终究输入运用迅速对齐或最好对齐技巧。

5、错配解读

错配解读的目标是找到一切能够的退火位点的DNA序列的引物在默许。此性能可用于PCR和DNA测序的引物选择。权重矩阵用来辨别引物定位的主要性。因为引物在3rsquo;结尾对方针DNA的婚配比PCR扩增的5结尾更主要，所以更多的权重被付与3rsquo;结尾。为了提升PCR引物的特异性，应一直检阅引物与靶DNA之间是不是存在次级退火位点。

更新日记

1、将bug扫地出门开启究竟。

2、有史以来最不变版本。

小编点评

向此软件中输入一段DNA序列，它会自动计算出原序列的反向互补序列，节省论文写作的时间。在设计引物时，导入目的基因，修改温度设定，便可以检测出这段引物的Tm值，用户可根据结果增删碱基数量，提高稳定性。

以上就是软件爱好者小编今日为大家带来的Dnaman，更多软件下载尽在软件爱好者。