游戏与之前的口袋妖怪游戏相同，记录了一位年轻的神奇宝贝训练家训练神奇宝贝、进行神奇宝贝对战并挫败敌对组织计划的故事。游戏加入了包括任天堂Wi-Fi连接、神奇宝贝华丽大赛和107只新神奇宝贝在内的许多特色要素。发布的两个版本彼此独立，但剧情基本相同，可以独立游戏并交换限定的神奇宝贝以收集神奇宝贝图鉴。
在发售的46天内，《口袋妖怪 钻石·珍珠》共售出三百万份，在任天堂DS游戏中首屈一指；2006年年底，游戏销量达到五百万，成为了日本国内最热销的口袋妖怪系列游戏。
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